Curso de Bioinformática Genômica

Noções e Aplicações em Bioinformática

Data: 14 a 18 de julho de 2008

Carga Horária: 40 horas

Inscrições

O registro é por e-mail. O espaço é limitado e será dada preferência aos estudantes e pesquisadores que trabalham em projetos nos quais bioinformática seja importante ou essencial.

Para realizar sua inscrição envie um resumo do trabalho com sua justificativa e motivação e um resumo de CV para o e-mail cursobioinfo2008@gmail.com.

Objetivos

• Compreender os conceitos básicos e alguns conceitos avançados de bioinformática e seus fundamentos e aplicações,
• prover o treinamento em ferramentas existentes e a compreensão da teoria e algoritmos sobre os quais estas se baseiam,
• prover uma introdução à análise de genomas,
• capacitar os participantes a utilisarem as ferramentas mais comuns e realizar uma analise crítica das mesmas,
• permitir o contato com novas tecnologias e sistemas,
• familiarizar os participantes com novos sistemas de análise de dados biológicos e novas tecnologias de sequenciamento e análise de expressão por microarranjos,
  
• apresentar recursos computacionais disponíveis na Internet e sua utilidade,
• discutir as necessidades dos usuários para a bioinformática da Embrapa.

Topicos de Interesse

• Bionformática Genômica
• Microarranjos
• Descoberta de Genes
• Biotecnologia
  

Promoção

• CNPq - Edital Universal
  
• Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
• Embrapa Trigo
• UFPF

Local

Embrapa Trigo
Rodovia BR 285, km 294
Passo Fundo - RS - Brasil - CEP 99001-970
Fone: (54) 3316-5800 Fax: (54) 3316-5801/5802

Facilitadores:

• Dr. Alexandre R. Caetano – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
• Dra. Paula Kuser Falcão – Embrapa CNPTIA
• Dr.Eliseu Binneck - Embrapa Soja
• Dra. Natália F. Martins - Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
  
• MsC. Marcus Teixeira - Universidade de Brasíila
• Dr. Georgios J. Pappas Jr. – Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia ( a confirmar)

Programa

1° Dia	2° Dia	3° Dia	4° Dia	5° Dia
Manhã Introdução a Bioinformática e conceitos Sequenciamento e genotipagem, Marcadores moleculares, microssatelites e SSRs Tarde Sistemas de armazenamento de dados e pré-processamento - SisGen	Manhã Análise de dados de sequenciamento, Armazenamento e recuperação dos dados - Tarde Uso dos programas CAP3, CONSED Uso de programas de análise filogenética	Manhã Buscas comparativas em banco de dados. Vias Metabólicas e assinaturas de proteínas. Tarde Análise de similaridade, buscas comparativas. Uso de programas de análise de busca	Manhã Estudos filogenéticos Evolução molecular Tarde Uso dos programas em Estudos de filogenia e evolução molecular	Manhã Microarranjos, Buscas de SNPs, novas tecnologias. Aplicações de Bioinformática na Embrapa. Tarde Apresentação de relatórios e resultados.

Metodologia

Aulas expositivas

Webminars

Leituras complementares

Discussões em grupo sobre revisões relevantes

Avaliação

Os alunos selecionados serão direcionados a projetos de pesquisa que serão desenvolvidos durante o curso e um resumo expandido será preparado e apresentado no último dia do curso.

Coordenação

Embrapa Trigo:

• Dr.Antonio Nhani
• Dra.Sandra Brammer

Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia

• Dra.Natália F. Martins
• MsC. Alexandre Magalhães Martins